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尺寸排阻層析（SEC），又稱凝膠過濾層析或者分子篩，當(dāng)某液體流經(jīng)多孔的凝膠結(jié)構(gòu)時(shí)，按照溶液中各分子的物理尺寸不同，將液體流動(dòng)相中各分子進(jìn)行分離。直徑大于填料孔徑的分子無法進(jìn)入孔里面，它們被完全排除，迅速通過柱子，并首先洗脫。按分子量大小的順序，直徑越小的分子，越能夠進(jìn)入填料的孔隙間，能滲入的體積也越大，洗脫也越晚。因?yàn)槌叽缗抛鑼游觯⊿EC）法對(duì)分子沒有吸附能力，其分離機(jī)制會(huì)使樣品稀釋洗脫，故通常它不用于層析工藝中的捕獲階段或中間純化步驟。有時(shí)它可用作最后的拋光精制階段，即將目標(biāo)蛋白從其聚合物或其他分子量顯著不用的雜質(zhì)中分離出來。另一個(gè)應(yīng)用領(lǐng)域是將純化后的目標(biāo)蛋白脫鹽。